Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CBX8Q9HC52 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBX8Q9HC52 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms