Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NANOGQ9H9S0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NANOGQ9H9S0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGQ9H9S0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms