Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C11orf49Q9H6J7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C11orf49Q9H6J7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C11orf49Q9H6J7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms