Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FNDC4Q9H6D8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms