Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B8

DPEP3, Dipeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPEP3Q9H4B8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
DPEP3Q9H4B8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DPEP3Q9H4B8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DPEP3Q9H4B8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DPEP3Q9H4B8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DPEP3Q9H4B8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms