Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB1Q9H4B7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB1Q9H4B7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms