Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF3Q9H094 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF3Q9H094 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF3Q9H094 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms