Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM4Q9C037 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms