Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms