Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFAF3Q9BU61 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms