Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM175Q9BSA9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM175Q9BSA9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM175Q9BSA9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms