Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERP44Q9BS26 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP44Q9BS26 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms