Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC39A3Q9BRY0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms