Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP23Q9BRU9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UTP23Q9BRU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UTP23Q9BRU9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms