Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOXF2Q9BQY4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOXF2Q9BQY4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms