Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FYCO1Q9BQS8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.5
FYCO1Q9BQS8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
FYCO1Q9BQS8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms