Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms