Protein–RNA interactions for Protein: Q99808

SLC29A1, Equilibrative nucleoside transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A1Q99808 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC29A1Q99808 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC29A1Q99808 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms