Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNKPQ96T60 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNKPQ96T60 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms