Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALPK3Q96L96 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALPK3Q96L96 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALPK3Q96L96 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms