Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SGSM3Q96HU1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGSM3Q96HU1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms