Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPNQ96H22 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPNQ96H22 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.1 ms