Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC3Q96F86 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
EDC3Q96F86 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EDC3Q96F86 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms