Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC51Q96ER9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC51Q96ER9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms