Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM19Q96E16 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM19Q96E16 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM19Q96E16 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms