Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMIGD2Q96BF3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms