Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX21Q969T3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX21Q969T3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX21Q969T3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX21Q969T3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms