Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF3Q92576 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF3Q92576 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF3Q92576 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms