Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC7Q8WUI4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC7Q8WUI4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC7Q8WUI4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms