Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIPK4Q8NE63 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIPK4Q8NE63 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms