Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE62

CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHDHQ8NE62 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHDHQ8NE62 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHDHQ8NE62 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHDHQ8NE62 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHDHQ8NE62 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHDHQ8NE62 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHDHQ8NE62 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms