Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE28

STKLD1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STKLD1Q8NE28 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STKLD1Q8NE28 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STKLD1Q8NE28 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STKLD1Q8NE28 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STKLD1Q8NE28 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
STKLD1Q8NE28 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
STKLD1Q8NE28 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STKLD1Q8NE28 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STKLD1Q8NE28 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STKLD1Q8NE28 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STKLD1Q8NE28 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STKLD1Q8NE28 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STKLD1Q8NE28 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STKLD1Q8NE28 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STKLD1Q8NE28 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms