Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASGEF1CQ8N431 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASGEF1CQ8N431 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGEF1CQ8N431 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms