Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EID3Q8N140 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms