Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA5Q8N114 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA5Q8N114 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms