Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN12Q8IYM2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLFN12Q8IYM2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms