Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMKLAQ8IXN7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMKLAQ8IXN7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMKLAQ8IXN7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMKLAQ8IXN7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMKLAQ8IXN7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms