Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC50Q8IVM0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms