Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5Q86VQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5Q86VQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCA5Q86VQ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms