Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMC3Q7Z5M5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMC3Q7Z5M5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMC3Q7Z5M5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms