Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX8Q7RTT4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX8Q7RTT4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms