Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CD109Q6YHK3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CD109Q6YHK3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CD109Q6YHK3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms