Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HACD2Q6Y1H2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms