Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM88Q6PEY1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM88Q6PEY1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms