Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLC3Q6P597 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLC3Q6P597 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLC3Q6P597 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms