Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD6Q6NYC1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD6Q6NYC1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD6Q6NYC1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms