Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEG0

SNRNP48, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP48Q6IEG0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP48Q6IEG0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNRNP48Q6IEG0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRNP48Q6IEG0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms