Protein–RNA interactions for Protein: Q68D51

DENND2C, DENN domain-containing protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2CQ68D51 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2CQ68D51 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2CQ68D51 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2CQ68D51 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms