Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LARP1BQ659C4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP1BQ659C4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms