Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND4CQ5VZ89 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND4CQ5VZ89 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND4CQ5VZ89 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND4CQ5VZ89 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DENND4CQ5VZ89 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND4CQ5VZ89 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND4CQ5VZ89 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms